В 2001 году Наталия Кугель смогла получить грант за проект «Театр Доктора Дапертутто». Проект предполагал актеров живого плана, работающих с куклами-марионетками. Тогда было сложно представить, что план получится реализовать, но благодаря решению Правительства Пензенской области от 2003 года бывший Музей Мейерхольда был реорганизован в Центр театрального искусства «Дом Мейерхольда», благодаря чему и возникла профессиональная актерская труппа и проект «Театр Доктора Дапертутто» начал воплощаться в жизнь.

В труппу театра набрали только мужчин. Такое решение было продиктовано условиями проекта, тяжелыми физическими нагрузками и самой идеей Мейерхольда. В труппе театра работают исключительно профессионалы, имеющие образование актеров-кукольников, драматических актеров и музыканты. Вся работа театра строится на исполнении вокальных номеров и музыкальных партий вживую, на развитии пластического и хореографического мастерства актеров.

Театр Доктора Дапертутто является участником российских и международных фестивалей и один из самых востребованных театров региона.